苯丙酮尿症：该病系婴儿肝内先天缺乏苯丙氨酸，喂养后可引起婴儿的神经系统损害。该病儿只能进食含量很低的苯丙酸代乳品。
半乳糖血症：患此病婴儿缺少半乳糖-磷酸尿苷转化酶，进食含有乳糖的母乳，可引起半乳糖代谢异常，引起婴儿神经系统病变而发生智力低下、白内障、黄疸、低血糖等病。此种情况，应以不含乳糖的代乳品喂养，母乳、牛乳均与该病婴儿无缘。
砚糖浆脲症：婴儿缺乏支酮酸脱羧酶，进食母乳易引起氨基酸代谢异常，导致严重的神经系统损害。该类婴儿只能选用分支氨基酸含量最低的合成氨基酸食物，进食母乳也只能占很小的比例，丰盛的母乳“爱莫能助”。
母体的部分疾病，也不宜喂养其乳汁，因为部分疾病患者强行喂养会产生一些恶果，给母体和婴儿造成危害。
如有严重的心脏病、心功能不全者，严重的肾脏疾病、严重的肝脏疾病、精神病、癫痫病等均为不宜，因为哺乳会增加母亲的负担，无疑会造成病情恶化。
哺乳期间有病毒感染者，为了婴儿的安全和健康也不宜喂养母乳。如巨细胞病毒急性感染期、人类T-淋巴细胞病毒感染、爱滋病病毒阳性、乙型病毒性肝炎患者HBeAg和HBsAg阳性、结核菌感染、梅毒血清阳性等，均不宜喂养母乳，以免将这些病毒细菌传播给无辜的婴儿。
